MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 chromosome

Total Repeats: 6897

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_009484	TGA	2	6	2512612	2512617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_009484	CAG	2	6	2512721	2512726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_009484	GTC	2	6	2513106	2513111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5004	NC_009484	CGC	2	6	2513135	2513140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_009484	TCAG	2	8	2513155	2513162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_009484	CAC	2	6	2513575	2513580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5007	NC_009484	CCGG	2	8	2514112	2514119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5008	NC_009484	CCT	2	6	2514163	2514168	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5009	NC_009484	GAC	2	6	2514215	2514220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_009484	GAT	2	6	2514239	2514244	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_009484	GCG	2	6	2514336	2514341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_009484	CTC	2	6	2515110	2515115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_009484	CG	3	6	2515145	2515150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_009484	A	7	7	2515918	2515924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_009484	CGG	2	6	2515932	2515937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_009484	CGG	2	6	2515940	2515945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_009484	CGGT	2	8	2516003	2516010	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_009484	CTGT	2	8	2516065	2516072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_009484	ACGG	2	8	2516086	2516093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5020	NC_009484	TCC	2	6	2518963	2518968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5021	NC_009484	TTTC	2	8	2518974	2518981	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_009484	TGC	2	6	2519013	2519018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_009484	C	6	6	2521322	2521327	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5024	NC_009484	GGC	2	6	2521354	2521359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5025	NC_009484	CAG	2	6	2521407	2521412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_009484	CA	3	6	2523759	2523764	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5027	NC_009484	ATGCG	2	10	2523877	2523886	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5028	NC_009484	CGG	2	6	2523923	2523928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_009484	GGC	2	6	2523950	2523955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5030	NC_009484	GTC	2	6	2523984	2523989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_009484	ATCCC	2	10	2524002	2524011	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5032	NC_009484	T	6	6	2524040	2524045	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_009484	GTT	2	6	2524194	2524199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_009484	AT	3	6	2524214	2524219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5035	NC_009484	AT	3	6	2524227	2524232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_009484	AG	3	6	2524276	2524281	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5037	NC_009484	A	6	6	2524357	2524362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5039	NC_009484	GCAAT	2	10	2524471	2524480	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5040	NC_009484	CGGG	2	8	2524804	2524811	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5041	NC_009484	GCTG	2	8	2524813	2524820	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5042	NC_009484	CGG	2	6	2524859	2524864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_009484	TG	3	6	2524891	2524896	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_009484	CCT	2	6	2524961	2524966	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5045	NC_009484	GCG	2	6	2524968	2524973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_009484	GC	4	8	2524985	2524992	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5047	NC_009484	CG	3	6	2524994	2524999	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_009484	TATT	2	8	2525034	2525041	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_009484	GTTT	2	8	2525064	2525071	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5050	NC_009484	TAT	2	6	2525109	2525114	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_009484	TAT	2	6	2525132	2525137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_009484	ATT	2	6	2525177	2525182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_009484	AAT	2	6	2525205	2525210	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_009484	GAAA	2	8	2525233	2525240	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_009484	A	6	6	2525238	2525243	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_009484	GGCG	2	8	2526001	2526008	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5057	NC_009484	TTG	2	6	2526018	2526023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5060	NC_009484	GCA	2	6	2526104	2526109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_009484	CCA	2	6	2526122	2526127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_009484	GC	3	6	2526132	2526137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5063	NC_009484	ATC	2	6	2526145	2526150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_009484	GCG	2	6	2526207	2526212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_009484	GGC	2	6	2526213	2526218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_009484	CGC	2	6	2526254	2526259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5067	NC_009484	GGC	2	6	2526267	2526272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_009484	GC	3	6	2526280	2526285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_009484	TA	3	6	2526341	2526346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_009484	CG	4	8	2526349	2526356	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_009484	CGACG	2	10	2528599	2528608	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5072	NC_009484	CGA	2	6	2528617	2528622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_009484	GCCGG	2	10	2528641	2528650	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5074	NC_009484	GC	3	6	2528651	2528656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_009484	GGC	2	6	2528663	2528668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5078	NC_009484	ATT	2	6	2530011	2530016	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_009484	CGG	2	6	2530078	2530083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5083	NC_009484	CG	3	6	2532163	2532168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5084	NC_009484	TC	3	6	2532199	2532204	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_009484	CGA	2	6	2532220	2532225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_009484	GGC	2	6	2532227	2532232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5087	NC_009484	CCG	2	6	2532270	2532275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5088	NC_009484	CAA	2	6	2532290	2532295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5089	NC_009484	GGCGC	2	10	2532336	2532345	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5090	NC_009484	GC	3	6	2532363	2532368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5091	NC_009484	GGCGCG	2	12	2532389	2532400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5094	NC_009484	GACAG	2	10	2532498	2532507	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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5098	NC_009484	CCAG	2	8	2535038	2535045	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_009484	CGCC	2	8	2535075	2535082	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5100	NC_009484	CGG	2	6	2536028	2536033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5102	NC_009484	GGC	2	6	2536132	2536137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5103	NC_009484	GTC	2	6	2536175	2536180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5105	NC_009484	CGCC	2	8	2536979	2536986	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5107	NC_009484	GCCCG	2	10	2537785	2537794	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5108	NC_009484	CGA	2	6	2537821	2537826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_009484	CGCT	2	8	2537832	2537839	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5110	NC_009484	GTC	2	6	2537844	2537849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_009484	CGC	2	6	2537855	2537860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5112	NC_009484	CGGG	2	8	2537868	2537875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_009484	CGG	2	6	2537886	2537891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_009484	CCAGCA	2	12	2537899	2537910	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_009484	T	6	6	2537952	2537957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_009484	GGGC	2	8	2538005	2538012	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5117	NC_009484	CCGG	2	8	2538049	2538056	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_009484	AACCG	2	10	2539339	2539348	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5119	NC_009484	TTTG	2	8	2539364	2539371	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_009484	TCA	2	6	2539463	2539468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5126	NC_009484	CAC	2	6	2541451	2541456	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5127	NC_009484	GCC	2	6	2541463	2541468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_009484	TCG	2	6	2541482	2541487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5132	NC_009484	CCG	2	6	2541732	2541737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5133	NC_009484	CTCC	2	8	2541772	2541779	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5134	NC_009484	GCA	3	9	2541827	2541835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5136	NC_009484	CCG	2	6	2541867	2541872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5137	NC_009484	CGC	2	6	2546460	2546465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5141	NC_009484	CAT	2	6	2548427	2548432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5255	NC_009484	GCC	2	6	2586885	2586890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5256	NC_009484	TTCAA	2	10	2586903	2586912	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
5257	NC_009484	CCTCT	2	10	2586921	2586930	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5258	NC_009484	CGT	2	6	2586967	2586972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5259	NC_009484	TC	3	6	2587113	2587118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5260	NC_009484	GACA	2	8	2587225	2587232	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5261	NC_009484	CAG	2	6	2587254	2587259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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